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常见问题

 

Q1没有参考基因组的物种是否能做CircRNA测序分析呢?

A:在CircRNA预测时,测序clean reads需要与参考基因组比对,从比对结果中提取Unmapped Reads,然后截取每一条Unmapped Reads的两端(默认20bp),得到Anchors Reads,得到准确的成环剪接位点(breakpoint);如果没有参考基因组或者只有无参转录组得到的Unigene,可能会由于拼接错误等造成CircRNA预测不准确,所以为了得到准确的分析结果,需要选择有参考基因组物种进行分析。  


circRNA

circRNA测序—研究circRNA的差异表达如何影响生物学过程

环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类特殊的非编码RNA分析,测序采用Illumina测序平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析, 环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。
  • 高效:定量准确、检出率高:

    基于高通量测序,依据主流数据库和circRNA鉴定软件,分析项目物种的circRNA信息,深入挖掘circRNA在转录调控中所发挥的
    重要功能。

应用方向

circRNA测序适合生命体生长发育等各个阶段、部位或方面的研究。
  • 生长发育

    人、小鼠、果蝇等细胞、组织生长发育研究。
  • 癌症疾病

    肿瘤、代谢病、免疫病等疾病发生与诊治研究。
  • 植物

    植物胁迫、生长发育、遗传育种等研究。


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