空间多组学
组合式空间多组学平台是开泰生物提供的端到端空间生物学解决方案：在保留细胞原始空间位置信息的前提下，对组织切片中的基因组、表观遗传组、转录组、表观转录组、蛋白组与微生物组进行高分辨率、高通量原位检测，并支持按项目需求自由组合。空间组学被《自然》（Nature）评为 2022 年度颠覆性技术之一，它突破传统组学丧失空间信息的局限，直观揭示组织的空间异质性、微环境特征。
六大空间组学模态
| 组学模态 | 可解析的内容 |
|---|
| 空间基因组 | DNA 变异、CNV、克隆结构与组织区域关联 |
| 空间表观遗传组 | 染色质开放性 / DNA 甲基化等调控层信息 |
| 空间转录组 | mRNA 表达谱，识别细胞类型与功能状态 |
| 空间表观转录组 | RNA 修饰、编辑与转录后调控的空间模式 |
| 空间蛋白组 | 抗体标签蛋白表达，解析信号通路与免疫微环境 |
| 空间微生物组 | 组织原位微生物分布、宿主互作与生态位 |
可选组合模式
单组学检测：聚焦单一模态，快速切入特定科学问题；
双组学联合：如 转录 + 表观 / 转录 + 蛋白，叠加调控维度；
三组学及以上整合：转录 + 表观 + 蛋白（tri-omics）等多层共谱；
病理图像联合：与 HE、IF、IHC 病理图像联合分析，形态—分子对照。
分析服务菜单（节选）
| 模块 | 基础分析（标准交付） | 个性化分析（可选） |
|---|
| 转录组 | 质控、比对、表达矩阵、UMI/Gene 统计、批次校正、PCA/UMAP、Spots 聚类 | monocle3 拟时序、CellPhoneDB 细胞通讯、Squidpy 邻域、hdWGCNA、TCGA 生存、SVG、ssGSEA |
| ATAC | 预处理、条形码解码、片段文件、TSS 富集、降维、无监督聚类、差异可及区域 | DAR、scATAC 反卷积、ATAC-RNA 联合、TF-Motif 空间映射、GREAT 注释 |
| CITE | RNA/ADT 矩阵、归一化、单模态聚类 | WNN 多模态联合聚类、空间映射 |
| 表观-转录共谱 | 多组学矩阵生成、降维、单模态聚类、差异分析 | WNN 联合、scRNA/scATAC 整合、表观-转录交叉标签转移、峰值-基因链接预测 |
应用方向
解析空间异质性：识别功能区域、病理边界与分子亚型，助力精准分型；
揭示疾病机制：将标志物表达与空间坐标对应，解析细胞互作与微环境重塑；
追踪发育轨迹：构建不同阶段的空间基因表达图谱；
评估空间响应：定位治疗响应热点、耐药生态位，为靶点发现提供依据。
样本要求与服务流程
闭环式交付：样本评估 → 组织切片 → 质量确认（RNA 质检 / HE）→ 多组学原位捕获（空间条形码编码）→ 核酸 / 蛋白 / 微生物 → 测序建库 → 高通量测序 → 整合分析（空间定位）→ 报告交付（项目解读）。样本形式含 FF 包埋块 / 冰冻组织等；运输依样本类型选择干冰 / 液氮 / 冰袋；样本须为非传染性。
交付物
结构化、可追溯的标准报告包：空间组学样本信息单、RNA 质检报告、空间编码裂解报告、空间 HE 染色报告、测序质量报告、空间转录组质检报告、ROI 区域确定、样本分析报告。
为什么选择开泰
① 端到端一站式；② 组合式灵活（6 大空间组学自由组合，并与 HE / IF / IHC 病理图像联合）；③ 高分辨 · 高通量（近单细胞分辨率，全转录组约 2 万基因，多种 RNA 空间表达谱）；④ 广泛样本兼容（FF / FFPE / OCT）；⑤ 深度分析菜单（5 大模块、数十项分析条目，含多组学联合与公共数据库整合）；⑥ 专业全程支持（技术 + 生信团队全程支持）。
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